يكي از مهم ترين تحولات زمان حيات امام محمد باقر عليه السلام انقراض سلسله ي بني اميه و تأسيس خلافت بني عباس مي باشد. امويان از سال 41 هجري تا سال 132 هجري قمري خلافت نمودند. تعداد خلفاي ايشان چهارده و مدت خلافتشان حدود نود و يكسال بوده است. خلافت آنها با معاوية ابن ابي سفيان شروع و سپس خلفاي ديگري بني اميه به شرح زير مي باشند:

معاوية بن ابي سفيان، يزيد بن معاويه، معاويه ثاني، مروان اول، عبدالملك بن مروان، وليد، سليمان، عمر بن عبدالعزيز، يزيد ثاني، هشام، وليد ثاني، يزيد ثالث، ابراهيم، مروان ثاني كه او را مروان حمار مي گفتند و در نبردي با ابومسلم خراساني شكست خورد و كشته شد.