و من العلوم التي خاضها الامام أبوجعفر عليه السلام تفسير القرآن الكريم، و قد أخذ عنه علماء التفسير - علي اختلاف آرائهم و ميولهم - الشي ء الكثير، فكان عليه السلام، من ألمع المفسرين في الاسلام، و من جملة علوم القرآن و شؤونه التي بحثها عليه السلام في محاظراته عن التفسير مايلي :