قسمت اعظم تفسير سوره يوسف را حضرت امام محمدباقر عليه السلام بيان فرموده و نكات لطيفي كه از اين سوره احسن القصص در ميان است از آن حضرت نقل شده كه چون ما در كتاب تاريخ انبياء مفصل نوشته ايم تكرار سخن نمي كنيم.

درباره حضرت ايوب و موسي و هارون تمام نكات تاريخي كه نقل شده در ضمن تفسير آيات شريف بيان فرموده است و درباره خضر و يوشع و حزقيل نيز اخباري را از آن حضرت نقل نموده اند و هم چنين درباره الياس و لقمان و اشموئيل احاديث بسيار وارد است و تقريبا تفسير سوره لقمان را با شرح حال داود پيغمبر صلي الله عليه و آله و سلم و قضاوت هاي او بيان فرموده است و احوال اصحاب سبت را و سلطنت سليمان را مفصل بيان از مواعظ و نصايح بيان فرموده است و سيره تاريخ حضرت يحيي و زكريا و مريم و عيسي (ع) را با سير تاريخي آنها و نكات دقيقي كه از آيات و احاديث مشهور بوده همه را از امام محمدباقر عليه السلام نقل فرموده است سپس احوال ارميا و دانيال و عزير و يونس و اصحاب كهف و رقيم و اخدود و خالد بن سنان و پيغمبراني كه در قرآن و حديث خبري از آنها نبوده، امام محمدباقر عليه السلام از آنها خبر داده است كه ما در كتاب تاريخ نقل كرده ايم.